Analyse Transcriptomique Et Biologie Int grative

Dans le cadre de l'tude des mcanismes molculaires impliqus dans les processus biologiques lis aux pathologies, la transcriptomique permet d'tudier l'expression de plusieurs milliers de gnes en une seule exprience. De nombreux algorithmes permettent la gestion, le traitement et l'analyse de cette grande quantit de donnes d'expression. Un des grands dfis d'aujourd'hui rside dans l'interprtation de ces donnes exprientales, notamment par l'intgration de connaissances biologiques supplmentaires permettant la cration d'un contexte d'tude aidant la comprhension des mcanismes biologiques et physiopathologiques. Cet ouvrage introduit les notions indispensables l'analyse des donnes transcriptomiques, et propose d'introduire la notion de biologie intgrative. Nous illustrerons ces concepts en proposant des mthodes et outils ncessaires l'exploitation de ces donnes dans le contexte biologique du cancer du foie : l'environnent M@IA propose une approche de biologie intgrative, une mthode de mta-analyse de donnes d'expression de gnes et une plateforme d'analyse croise de donnes transcriptomiques et d'imagerie mdicale.