Automatisierung der morphometrischen Analyse des Neokortex von Tau-transgenen Musen

Bachelorarbeit aus dem Jahr 2008 im Fachbereich Informatik - Sonstiges, Note: 1,3, Universitt Osnabrck, 26 Quellen im Literaturverzeichnis, Sprache: Deutsch, Abstract: Die Alzheimer-Krankheit ist eine degenerative Hirnerkrankung mit progredienter Hirnatrophie (bis zu zehn Prozent) unter Bildung bestimmter pathologischer Vernderungen im Gehirn. Tau bildet im Gehirn von Alzheimer-Patienten fibrillre Aggregate (neurofibrillary tangles", NFTs) in Neuronen und krankheitstypische Tauformen (paired helical filaments", PHFs) im Gehirn. Dies fhrt zu einer Fehlfunktion der Mikrotubuli, was wahrscheinlich zum Zelltod der Neurone in Tauopathien wie bei Alzheimer fhrt. Um mehr ber die Hintergrnde zu erfahren, die den Gewebsverlust verursachen, wurde der Neokortex
(NC) von tau-transgenen Musen, so wie der von nicht-transgenen Kontrolltieren morphometrisch analysiert. Dabei wurden Muse verwendet, die transgen fr Wildtyp-Tau oder fr eine pseudohyperphosphorylierte Variante von Tau (PHP-Tau) waren. Hierbei wurden sowohl die Dichte als auch die Gre
der Neurone im NC bestimmt. Fr die Analyse wurden Hirnschnitte in 50 m Dicke angefertigt, in denen die Nervenzellkrper durch NeuN Immunfrbung deutlich sichtbar sind. Nach Erstellen von Bildern des gewnschten Analysebereiches mit einem konfokalen Laser-Scanning-Mikroskop wurde die Bildserie mit der Software
ImageJ bearbeitet. Da die Bestimmung der Neuronenanzahl sowie der Neuronendichte von jedem einzelnen Bild erfolgen muss, war diese Art der Analyse sehr zeitaufwendig. Ziel der Arbeit war es, die morphometrische Analyse zu automatisieren und eine neue Analysemethode zu etablieren. Dies wurde erreicht, in dem zwei Plugins geschrieben wurden, die es ermglichen einen Arbeitsschritt auch an einer Bildserie anwenden zu knnen. Die Automatisierung gewhrleistet so eine schnelle und fehlerfreie Analyse, da Bearbeitungsfehler auf ein Minimum reduziert werden. Dadurch wird eine effiziente und
standardisierte Bearbeitung des g