Simulação de dados de experimentos de mapping by sequencing

Avancos recentes nas tecnologias de sequenciamento de nova geracao (NGS) reduziram o tempo necessario para a identificacao de mutacoes em genetica forward, uma das principais formas para caracterizacao da funcao de genes em plantas. A metodologia utilizada para a identificacao de mutacoes induzidas por agentes mutagenicos fisicos ou quimicos em uma populacao de mapeamento e conhecida como mapping-by-sequencing. Dentre as varias tecnicas que utilizam esta metodologia, Next-generation mapping (NGM) ganha destaque por necessitar de um numero pequeno de mutantes na populacao de mapeamento. Entretanto, nos trabalhos publicados, nao fica claro o porque da utilizacao dos parametros usados para formacao da populacao de mapeamento (numero de individuos, numero de mutantes, forma de cruzamento) e para o sequenciamento (plataforma utilizada, metodo de sequenciamento, cobertura) nos experimentos. Por isso, desenvolveu-se um pipeline de bioinformatica que possibilita a simulacao de dados de experimentos que utilizam a tecnica de NGM com a planta modelo Arabidopsis thaliana, uma das plantas mais estudas e sequenciadas na literatura.