Squenage de l'ADN

L'adénocarcinome du côlon est le type de cancer gastro-intestinal le plus courant. C'est pourquoi le séquençage de l'ADN des fragments d'ADNc a été effectué sur une lignée cellulaire Caco-2. Cette expérience a été réalisée pour trouver des marqueurs biologiques potentiels de la cellule cancéreuse ou de l'entérocyte normal, qui peuvent être utiles pour le diagnostic de la maladie. Le séquençage de l'ADN a été effectué en utilisant la méthode de terminaison de chaîne avec des ddNTP marqués et leur lecture par un séquenceur d'ADN (Beckman Coulter CEQ 2000). Sur les 11 séquences obtenues avec succès, 5 fragments acquis ont été partiellement mis en correspondance avec des séquences d'ADN humain et ont révélé que les gènes complets, auxquels appartiennent ces fragments, coderaient 3 protéines humaines différentes. Ces protéines sont la sous-unité Beta-2-Like 1 de la protéine de liaison au nucléotide guanine, la protéine 4 de liaison à l'ADN de l'hélicase chromodomaine et la protéine J du centromère. Il s'est avéré qu'elles contribuent ou inhibent les phénotypes cancéreux des cellules, ce qui pourrait s'expliquer par la quantité de protéines dans la cellule et le niveau de mutations qu'elles possèdent. Cette étude révèle la nécessité de poursuivre les recherches sur les lignées cellulaires cancéreuses et le séquençage de leur ADN.