Structure de Mol cules d''int r t Pharmaceutique En Phase Gazeuse

Les caractristiques structurales et les interactions intra et/ou intermolculaires non-covalentes jouent un rle primordial dans l'activit des molcules d'intrt biologique, notamment lors de la reconnaissance molculaire entre un mdicament et son rcepteur. Il est donc intressant de dcrire les structures intrinsques de peptides, d'oligonuclotides ou de complexes d'intrt pharmaceutiques en phase gazeuse. Pour cela, nous prenons appui sur deux techniques exprimentales complmentaires, la spectroscopie IRMPD et la spectromtrie de mobilit ionique, dont les rsultats sont compars avec des simulations. Dans ce travail de thse, j'ai d'abord test les prdictions d'une mthode QM/MM en ce qui concerne le calcul des spectres IR d'espces d'intrt biologique isoles. J'ai ensuite utilis cette mthode pour simuler les spectres IR de brins de la protine amylode en phase gazeuse. Je me suis galement intress aux changements de structure induits par la complexation d'un antibiotique, la vancomycine, avec un modle de son rcepteur.