Variations du gnome du VIH-1

L'objectif des travaux de recherche décrits dans cet ouvrage était de développer des outils moléculaires susceptibles d'aider les cliniciens à prendre des décisions thérapeutiques plus éclairées à l'égard de leurs patients infectés par le VIH-1. Nous avons démontré que l'utilisation de la séquence partielle du gène p24 du VIH-1 peut servir d'outil pour le sous-typage viral. Nous présentons un test de charge virale du VIH-1 qui est robuste, fiable, économique et efficace dans des contextes où les ressources sont limitées, comme en Inde. Grâce à une étude approfondie portant sur 206 séquences du gène RT du VIH-1, une méthode efficace et économique de génotypage de la résistance aux médicaments du VIH-1 a été mise au point et validée cliniquement. Un processus basé sur l'extension des amorces a été exploré pour sa capacité à interroger les polymorphismes nucléotidiques simples cliniquement importants dans le génome du VIH-1, indiquant ainsi son potentiel en tant que système de détection de mutation du VIH-1 rentable, sensible et spécifique. Enfin, nous avons décrit un test de génotypage du VHC, qui pourrait influencer les décisions thérapeutiques chez les patients co-infectés par le VIH-1 et le VHC. Notre travail apportera une valeur ajoutée à l'ensemble des outils disponibles pour une prise en charge globale du VIH-1 qui inclut le VHC en tant que co-infection.