Virus et prophages dans les cosystmes aquatiques

Les objectifs de ce travail visaient dterminer l'importance qualitative, quantitative et fonctionnelle des virus dans le Lac Pavin, en tenant compte des gradients lis la profondeur. Nous montrons que la dynamique de la diversit, de l'abondance et de l'activit lytique du virioplancton du lac est troitement associe celle des communauts microbiennes. La prise en compte de l'ensemble de la colonne d'eau indique que la structure des rseaux trophiques microbiens et la place des virus dans ces rseaux dpendent de la profondeur. Finalement, jusqu' 16 % du bactrioplancton serait lysogne. Ce mode de vie, antagoniste celui lytique, dpend de la disponibilit de l'hte et serait un mcanisme de survie virale, pouvant avoir une incidence sur l'volution adaptative des htes. Ces rsultats montrent que les virus seraient essentiels dans la diversification et l'cologie des communauts microbiennes, et dans les flux de matire et d'nergie circulant dans la colonne d'eau.