Variazioni del genoma dell'HIV-1

L'obiettivo del lavoro di ricerca descritto in questo libro era quello di sviluppare strumenti molecolari che potessero aiutare i medici a prendere decisioni terapeutiche più informate nei confronti dei loro pazienti infetti da HIV-1. Abbiamo dimostrato che l'uso della sequenza parziale del gene p24 dell'HIV-1 può funzionare come strumento per la sottotipizzazione virale. Abbiamo presentato un test per la carica virale dell'HIV-1 robusto, affidabile, economico ed efficace in contesti a risorse limitate come l'India. Attraverso un ampio studio su 206 sequenze del gene RT dell'HIV-1, è stato sviluppato e validato clinicamente un metodo di genotipizzazione della resistenza ai farmaci dell'HIV-1 efficace ed economico. È stato esplorato un processo basato sull'estensione del primer per la sua capacità di interrogare polimorfismi a singolo nucleotide clinicamente importanti all'interno del genoma dell'HIV-1, indicando così il suo potenziale come sistema di rilevamento delle mutazioni dell'HIV-1 economico, sensibile e specifico. Infine, abbiamo descritto un saggio di genotipizzazione dell'HCV, che ha il potenziale di influenzare le decisioni terapeutiche nei pazienti co-infettati da HIV-1/HCV. Il nostro lavoro aggiungerà valore all'attuale serie di strumenti disponibili per una gestione inclusiva dell'HIV-1 che includa l'HCV come coinfezione.